Первым проявлением восстания стали события 4 июля в городе Ходженте. 4 июля 1916 г. городская беднота и крестьяне собрались на демонстрацию против набора на тыловые работы. Крупнейшее восстание произошло 13-21 июля 1916 г. в Джизаке. В нем участвовало несколько тысяч человек. Наиболее массовый и организованный характер восстание носило именно в тех бухарских крепостях, которые оказали наиболее ожесточенное и длительное сопротивление русским войскам во время присоединения Средней Азии.

Также одним из первых восстание вспыхнуло в столице Туркестанского края – Ташкенте. Волнения в городе начались сразу же после обнародования указа. Первоначально было объявлено, что город должен поставить около 7 тыс. человек, но наряд по набору оказался в 2 раза больше. Сведения о значительном увеличении набора еще больше усилили возмущение. Впоследствии восстание охватило весь Туркестан. Во всех местах, охваченных волнениями, ситуация развивалась примерно одинаково.

Местные власти стали принимать экстренные меры по снижению напряженности в регионе. 18 июля 1916 г. Туркестан был переведен на военное положение. 30 июля 1916 г. был объявлен новый царский указ об отсрочке мобилизации до 15 сентября. В правящих кругах подумывали о полной отмене мобилизации для Туркестана.

Также в столице решили усилить местную администрацию, назначив ее главой командующего Северным фронтом и бывшего военного министра А.Н. Куропаткина. Из опыта полумесячной борьбы в крае Куропаткин сделал вывод, что следует придерживаться политики уступок и лавирования, что требовало обновить систему управления краем. Вновь назначенный генерал-губернатор ввел особый порядок, согласно которому количество мобилизуемых рабочих от каждой области, волости и уезда утверждали специально избранные представители от населения.

Дипломат С.В. Чиркин так характеризовал его деятельность:

«Назначение А.Н. Куропаткина главным начальником Туркестанского края нельзя было не признать крайне своевременным и удачным. Он был уже по прежней своей деятельности крайне популярен среди всех народностей, населяющих Туркестан. Он любил туземцев, был доступен для них и внимательно входил во все их нужды, зная хорошо их быт. Менее чем через два месяца по прибытии в Ташкент рядом лёгких мер при посредстве преданных ему влиятельных туземцев он добился не только того, что вызванное вышеуказанными распоряжениями брожение среди населения прекратилось, но даже своевременно без ропота формировались этапные тыловые рабочие отряды и отправлялись на фронт».

Уже в конце лета 1916 г. восстание было завершено в Самаркандской, Сырдарьинской, Ферганской и ряде других областей, а вначале октября было подавлено восстание и в Семиречье. Последние очаги протеста были зафиксированы в январе 1917 г. в Закаспийской области.